一、先要了解什么樣的樣品用什么類型的顯微鏡？

顯微鏡根據觀測樣品和不同功能劃分為：正置顯微鏡、倒置顯微鏡、體式顯微鏡、熒光顯微鏡、相差顯微鏡、偏光顯微鏡、金相顯微鏡、激光共聚焦顯微鏡等等。正置顯微鏡更適合觀察載玻片，倒置顯微鏡更適合培養皿的觀察，相差顯微鏡更適合活細胞和未染色的生物標本，熒光顯微鏡適合自發熒光和誘發熒光標本成像等等。

二、操作體驗的舒適性？

現在顯微鏡體驗的舒適性是顯微鏡的一大賣點，圖片同步顯示，投屏顯示，對保存的圖片直接進行修改和編輯，對于解放實驗者有很大幫助。

三、想要什么效果，放大多少倍？

真核細胞：10-100μm；原核細胞：1-10μm；細胞核：約7cm；線粒體：0.5-1μm；大多數病毒：20-100nm。光學顯微鏡可以區分200nm；更小的支原體和病毒等需使用電子顯微鏡進行觀察。光學總放大倍率=目鏡的倍率X物鏡放大倍率，數字總放大倍率=目鏡放大倍率X物鏡X數字放大率。所以要根據所觀察的樣品大小選擇合適的顯微鏡和配置。

四、光學系統的好壞？

分辨能力是觀察樣品細節的能力和圖像的解析速度——另一個需要考慮的重要因素。物鏡在光學系統中至關重要，物鏡的數值孔徑（NA）越高，分辨能力越強。用戶需要看到的細節程度和預算，選擇數值孔徑（NA）合適的物鏡。除了數值孔徑（NA），還需要評估顯微鏡物鏡對球差和色差的校正程度。選擇預算范圍內的物鏡。物鏡的品質將直接影響數據的質量，所以這是需要考慮的非常重要的因素。

市面上有多種類型和功能的顯微鏡供科學家選擇。有時，選擇可能是一邊倒的。比較好的方式就是根據自身需求做調研，做不同設備的比較，再加上對當前需求和未來計劃的評估。